في إطار تنفيذ الخطة الإستراتيجية لتطوير التعليم الجامعي تم التعاقد بين جامعة بنها ووزارة التعليم العالي (وحدة إدارة المشروعات) في 16/03/2014 على مشروع تطوير النظام الإداري بالجامعة للحصول على شهادة الأيزو 9001:2008 ... والذي يهدف إلى رفع كفاءة المنظومة الإدارية ووضع نظام إداري لبعض العمليات الإدارية المحددة داخل الجامعات مما يؤثر بالإيجاب في دعم العناصر الرئيسية الحاكمة بالجامعات وأيضا إلى نشر ثقافة الجودة في الإدارة وتدريب الكوادر وتطوير النظام الإداري بالجامعات ورفع مستوى أدائه طبقا للمعايير الدولية.